Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc87Q8CDL9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms