Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcinQ8CDE2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CcinQ8CDE2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms