Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacnb2Q8CC27 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms