Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb1Q8CBF3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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