Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrn3Q8CBC6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn3Q8CBC6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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