Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppfibp1Q8C8U0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms