Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1bQ8C7N7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1bQ8C7N7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms