Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ccdc113Q8C5T8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc113Q8C5T8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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