Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cwc22Q8C5N3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cwc22Q8C5N3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms