Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfrp1Q8C4U3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms