Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trim35Q8C006 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trim35Q8C006 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Trim35Q8C006 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim35Q8C006 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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