Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn17Q8BXA6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms