Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops7bQ8BV13 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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