Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rccd1Q8BTU7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms