Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8BPC6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q8BPC6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms