Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd3Q8BP97 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rhbdd3Q8BP97 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhbdd3Q8BP97 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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