Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grik4Q8BMF5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik4Q8BMF5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms