Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prpf18Q8BM39 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Prpf18Q8BM39 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prpf18Q8BM39 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms