Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJZ4

Mrps35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps35Q8BJZ4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrps35Q8BJZ4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrps35Q8BJZ4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms