Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Clrn3Q8BHH8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Clrn3Q8BHH8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clrn3Q8BHH8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clrn3Q8BHH8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clrn3Q8BHH8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clrn3Q8BHH8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clrn3Q8BHH8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Clrn3Q8BHH8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Clrn3Q8BHH8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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