Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubash3bQ8BGG7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubash3bQ8BGG7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms