Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms