Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc172Q810N9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc172Q810N9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms