Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ClspnQ80YR7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ClspnQ80YR7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms