Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zbed4Q80WQ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zbed4Q80WQ9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms