Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrc1Q80VQ1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms