Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpp38Q80UU2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms