Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Avl9Q80U56 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms