Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pja2Q80U04 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pja2Q80U04 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms