Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clasp1Q80TV8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clasp1Q80TV8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms