Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf8Q80TJ7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf8Q80TJ7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms