Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.1 ms