Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdp1Q7TSG2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdp1Q7TSG2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms