Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Dsg1bQ7TSF1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1bQ7TSF1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Dsg1bQ7TSF1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dsg1bQ7TSF1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dsg1bQ7TSF1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dsg1bQ7TSF1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dsg1bQ7TSF1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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