Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg1cQ7TSF0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg1cQ7TSF0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms