Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap2lQ7TS74 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms