Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim12Q78RX3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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