Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubfd1Q78JW9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms