Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mindy1Q76LS9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mindy1Q76LS9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms