Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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Atp8b3Q6UQ17 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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Atp8b3Q6UQ17 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b3Q6UQ17 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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