Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54bQ6PFE3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms