Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CtifQ6PEE2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms