Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt3Q6PE13 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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