Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6PD19 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q6PD19 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q6PD19 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6PD19 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q6PD19 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms