Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbtb40Q6PCS8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Zbtb40Q6PCS8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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Zbtb40Q6PCS8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Zbtb40Q6PCS8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Zbtb40Q6PCS8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Zbtb40Q6PCS8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms