Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Asic1Q6NXK8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asic1Q6NXK8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms