Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rprd2Q6NXI6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rprd2Q6NXI6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms