Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf6Q6NVF9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms