Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arhgap20Q6IFT4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms