Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca2Q6DIC0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms